Ο Μπαλντίνι ξεπέρασε στην καριέρα του τα 180.000 χιλιόμετρα σε αγώνες και προπονήσεις και πλέον αποφάσισε να την ολοκληρώσει, αν και δεν κατάφερε να το κάνει όπως θα ήθελε, αφού λόγω τραυματισμού δεν κατέβηκε να αγωνιστεί στις 9 Οκτωβρίου στον αγώνα 10 χλμ στο Τρέντο.

Ο αγώνας ήταν πάντα ένας από τους αγαπημένους του Μπαλντίνι και για το λόγο αυτό έκανε έναν γύρο τιμητικά για να αποχαιρετήσει τους φίλους και θαυμαστές του, αφού είχε μετάσχει συνολικά 12 φορές και είχε αναδειχθεί νικητής το 2002, το 2004 και το 2006.

" Λυπάμαι που αποχωρώ στα 39 χρόνια μου, αλλά πιστεύω ότι είναι η σωστή στιγμή. Ίσως παρέμεινα αρκετά περισσότερο, όμως κανένας στην Ιταλία δεν ήταν ικανός να με νικήσει. Θέλω να ευχαριστήσω τον πρώτο μου προπονητή Εμίλιο Μπενάτι, ο οποίος με καθοδήγησε μέχρι το 1992 και στη συνέχεια με προέτρεψε να μπω στην ομάδα του Λουτσιάνο Τζιλιότι. Ήμουν τυχερός που στην καριέρα μου συνάντησα τα σωστά άτομα", είπε ο Ιταλός δρομέας.

Το ντεμπούτο του στο Μαραθώνιο ο Μπαλντίνι το έκανε τον Οκτώβριο του 1995 στη Βενετία, όπου τερμάτισε 6ος με 2:11.01. Ένα χρόνο αργότερα κέρδισε τον τίτλο στο Παγκόσμιο πρωτάθλημα ημιμαραθωνίου στην Πάλμα ντε Μαγιόρκα. Συνολικά πήρε μέρος σε 27 Μαραθώνιους δρόμους από το 1995 μέχρι και το 2010.

Οι μεγάλες στιγμές της καριέρας του ήταν το χρυσό στην Αθήνα στην κλασική διαδρομή, τα δύο χρυσά μετάλλια στα Ευρωπαϊκά πρωταθλήματα στίβου του 1998 στη Βουδαπέστη και του 2006 στο Γκέτεμποργκ, τα δύο χάλκινα μετάλλια στα Παγκόσμια πρωταθλήματα του 2001 και του 2003 σε Έντμοντον και Παρίσι αντίστοιχα, το χρυσό στην Πάλμα ντε Μαγιόρκα στον ημιμαραθώνιο και τα εθνικά ρεκόρ που σημείωσε στο Λονδίνο στην απόσταση των 42.195μ, με 2:07:29 το 2002 και με 2:07:22 το 2006. Στο Μαραθώνιο της βρετανικής πρωτεύουσας συμμετείχε 9 φορές και κατετάγη δεύτερος το 1997 (2:07:57) και το 2003 (2:07:56).