Από εκεί και πέρα σε περίπτωση που ο "Δικέφαλος" αποκλείσει την ομάδα του Σφαιρόπουλου θα αντιμετωπίσει κατά πάσα πιθανότητα την Ολύμπια Λάρισας.
Tο αναλυτικό πρόγραμμα της δεύτερης φάσης:

Β΄Φάση: 1η αγωνιστική (27/9)
25. Κολοσσός Ρόδου-ΠΑΟΚ
26. Νικητής 20-Νικητής 22
27. Νικητής 18-Νικητής 33
28. ΕΚ Καβάλας-Νικητής 24
29. Νικητής 17-ΑΕΚ
30. Αιγάλεω ΑΟ-ΑΣ Τρίκαλα 2000
31. Νικητής 21-Ολύμπια ΑΓΕ
32. ΑΕΛ 1964 ΓΣ-Νικητής 19

Β΄Φάση: 2η αγωνιστική (01/10)
33. Νικητής 30-Νικητής 28
34. Νικητής 31-Νικητής 25
35. Νικητής 27-Νικητής 26
36. Νικητής 32-Νικητής 29

Β΄Φάση: 3η αγωνιστική (4/10)
37. Νικητής 36-Νικητής 36
38. Νικητής 33-Νικητής 34

*Οι ομάδες που τερμάτισαν από την πρώτη μέχρι την έκτη θέση (Παναθηναϊκός, Ολυμπιακός, Πανιώνιος, Μαρούσι, Άρης, Πανελλήνιος) συμμετέχουν στο Κύπελλο από την τρίτη φάση και μετά.

Προηγήθηκε η κλήρωση της πρώτης φάσης του Κυπέλλου, από την οποία θα προκύψουν οι ομάδες που θα συνεχίσουν στη 2η φάση και η οποία έχει ως εξής.

Α΄Φάση: 1η αγωνιστική (20/09)
1. ΜΑΣ Ερμής Λαγκαδά - ΑΟ Δάφνης
2. ΜΕΝΤ - ΑΟ Παγκρατίου
3. ΑΣΕ Δούκα - Ξάνθη ΑΣ
4. ΑΕ Ικάρου Καλλιθέας - ΑΟΚ Γουμένισσας
5. Πανερυθραϊκός ΑΣ - ΑΣ Απόλλων Πάτρας
6. ΑΓΕ Χαλκίδας - Πιερικός Αρχέλαος
7. ΑΟ Π. Φαλήρου - ΑΠΣ Αναγέννηση Φλόγα
8. Ηλυσιακός ΑΟ - ΑΓΟΡ
9. ΣΕΦΑ Αρκαδικός - ΜΓΣ Απόλλων Καλ.
10. Κεραυνός Αιγίου - ΑΟ Νήαρ Ηστ
11. ΓΑΣ Κομοτηνή - ICBS
12. ΑΟ Σπόρτιγκ - ΓΣ Ηρακλής 13. ΑΠΣ Αίας Ευόσμου - ΑΟΚ Ίκαροι Σερρών
14. ΟΦ Ηρακλείου - ΑΟ Αμύντας
15. ΓΣ Λαυρίου - ΚΑΟΔ
16. ΓΣ Περιστερίου - ΑΕΠ Ολύμπιας Πατρών

Α΄Φάση: 2η αγωνιστική (24/09)
17. Νικητής 14 - Νικητής 11
18. Νικητής 6 - Νικητής 3
19. Νικητής 5 - Νικητής 4
20. Νικητής 8 - Νικητής 10
21. Νικητής 1 - Νικητής 15
22. Νικητής 7 - Νικητής 13
23. Νικητής 9 - Νικητής 2
24. Νικητής 16 - Νικητής 12