O έμπειρος ποδοσφαιριστής κατά το παρελθόν έχει αγωνιστεί στον Απόλλωνα Λάρισας, τη Λάρισα, τον Εθνικό Αστέρα, την Ξάνθη, τον Ακράτητο, τον Θρασύβουλο και τον Αστέρα Τρίπολης.
Μετά την συμφωνία του με τη Δόξα Δράμας, ο Παπαθανασίου δήλωσε: "Είναι μεγάλη η χαρά μου που συμφώνησα με την ιστορική Δόξα. Με κέρδισαν ο προπονητής, Κώστας Βασιλακάκης, και ο πρόεδρος, Χαράλαμπος Νικολαϊδης, με το όραμά τους για μια ισχυρή Δόξα. Ανυπομονώ να ξεκινήσει το πρωτάθλημα και να αγωνιστούμε σε γεμάτες κερκίδες".