Αξίζει να σημειωθεί ότι σε αυτή συμμετείχαν σύλλογοι της Γ’ Εθνικής κατηγορίας και οι 18 που πέρασαν στην επόμενη φάση θα τεθούν αντιμέτωποι με ομάδες της Β’ Εθνικής.
Αναλυτικά τα αποτελέσματα και το πανόραμα

Α΄ ΦΑΣΗ (22-23/8/2009)


1. Ασπρόπυργος-Αίας Σαλαμίνας 3-1
2. ΠΑΟ Νέων Επιβατών-Παναιγιάλειος 4-2
3. Μακεδονικός-Εθνικός Φιλιππιάδας 2-0
4. Φωστήρας-Ατσαλένιος 0-3 (α.α.)
5. Εορδαϊκός-Κοζάνη 1-0
6. Αναγέννηση Γιαννιτσών-Χαϊδάρι 4-3
7. Πλατανιάς-Νίκη Βόλου 7-6 πέναλτι (κ.α. 2-2, παρ. 3-3)
8. Ρόδος-Κόρινθος 0-1
9. Φωκικός-Οδυσσέας Αναγέννησης 0-1 (κ.α. 0-0)
10. Βισαλτιακός-Κεραυνός Κερατέας 2-1
11. Σαρωνικός-Θερμαϊκός 3-0 (α.α.)
12. Παναργειακός-Βύζας 2-1 (κ.α. 1-1)
13. Δόξα Κρανούλας-Ζάκυνθος 4-3 πέναλτι (κ.α. 0-0, παρ. 0-0)
14. Πυρσός Γρεβενών-Καλλιθέα 5-6 πέναλτι (κ.α. 1-1, παρ. 1-1)
15. Παναχαϊκή-Ολυμπιακός Χερσονήσου 5-4 πέναλτι (κ.α. 0-0, παρ. 0-0)
16. Αναγέννηση Επανωμής-ΠΑΟ Ρουφ 2-0 παράταση (κ.α. 0-0)
17. Βέροια-Αγία Παρασκευή 1-0
18. Τρίκαλα-Καστοριά 3-0 (α.α.)

Β΄ ΦΑΣΗ (2/9/2009)

19. Ασπρόπυργος-Διαγόρας
20. ΠΑΟ Νέων Επιβατών-Ηλιούπολη
21. Μακεδονικός-Πανσερραϊκός
22. Ατσαλένιος-Εθνικός Αστέρας
23. Εορδαϊκός-Δόξα Δράμας
24. Αναγέννηση Γιαννιτσών-ΟΦΗ
25. Πλατανιάς-Θρασύβουλος
26. Κόρινθος-Καλαμάτα
27. Οδυσσέας Αναγέννησης-Αγροτικός Αστέρας
28. Βισαλτιακός-Κέρκυρα
29. Σαρωνικός-Εθνικός Πειραιά
30. Παναργειακός-ΑΣΚ Ολυμπιακός Βόλου
31. Δόξα Κρανούλας-Ιωνικός
32. Καλλιθέα-Απόλλων Καλαμαριάς
33. Παναχαϊκή-Αιγάλεω
34. Αναγέννηση Επανωμής-Πιερικός
35. Βέροια-Παναιτωλικός
36. Τρίκαλα-Αναγέννηση Καρδίτσας

Γ΄ ΦΑΣΗ (23/9/2009)


37. Νικητής 19-Νικητής 22
38. Νικητής 20-Νικητής 25

Δ΄ ΦΑΣΗ (28/10/2009)

39. Νικητής 21-Ολυμπιακός
40. Νικητής 23-Παναθηναϊκός
41. Νικητής 24-ΠΑΟΚ
42. Νικητής 26-ΠΑΣ Γιάννινα
43. Νικητής 27-Καβάλα
44. Νικητής 28-Ατρόμητος
45. Νικητής 29-Ξάνθη
46. Νικητής 30-Λάρισα
47. Νικητής 31-Λεβαδειακός
48. Νικητής 32-Πανθρακικός
49. Νικητής 33-Αστέρας Τρίπολης
50. Νικητής 34-Εργοτέλης
51. Νικητής 35-Πανιώνιος
52. Νικητής 36-Ηρακλής
53. Νικητής 37-Άρης
54. Νικητής 38-ΑΕΚ