Το καλοκαίρι του 2015 ο Ατρόμητος ανακοίνωσε την απόκτηση του Πάπε Έμποου. Ο Σενεγαλέζος άσος είχε μείνει ελεύθερος από τον Πανθρακικό και υπέγραψε για δυο χρόνια. Δυστυχώς για τον ίδιο ήρθε ένας σοβαρός τραυματισμός (ρήξη χιαστών) και τον έθεσε οφ μέχρι το τέλος της σεζόν.

Τελικά ο 28άχρονος άσος δεν θα προλάβει να δείξει την αξία του στον Ατρόμητο μιας και λύθηκε το συμβόλαιο του:

"H ΠΑΕΑτρόμητος ανακοινώνει ότι ο Πάπε Έμποου δεν θα συνεχίσει μαζί μας στην περίοδο 2016-17. Ο μεγάλος άτυχος της περσινής σεζόν και η ομάδα κατέληξαν από κοινού σε αυτή την απόφαση. Του ευχόμαστε καλή συνέχεια και περισσότερη τύχη στην καριέρα του!"