Το πρόγραμμα της κανονικής περιόδου έχει ως εξής:

1η Αγωνιστική (4/10/08) - 10η Αγωνιστική (17/1/09)

Ελπίδες Δράμας-Άρης Νίκαιας

Αναγέννηση Βύρωνα-Νέα Ιωνία

Αναγέννηση Άρτας-Άρης Θεσσαλονίκης

Εθνικός Κοζάνης-Μ. Αλέξανδρος Γιαννιτσών

ΑΣΕ Ορμή-ΑΕΠ Ξάνθης

2η Αγωνιστική (11/10/08) - 11η Αγωνιστική (24/1/09)

ΑΣΕ Ορμή-Ελπίδες Δράμας

Άρης Νίκαιας-Αναγέννηση Βύρωνα

Νέα Ιωνία-Αναγέννηση Άρτας

Άρης Θεσσαλονίκης-Εθνικός Κοζάνης

ΑΕΠ Ξάνθης-Μ. Αλέξανδρος Γιαννιτσών

3η Αγωνιστική (25/10/08) - 12η Αγωνιστική (7/2/09)

Αναγέννηση Βύρωνα-ΑΣΕ Ορμή

Αναγέννηση Άρτας-Άρης Νίκαιας

Εθνικός Κοζάνης-Νέα Ιωνία

Μ. Αλέξανδρος Γιαννιτσών-Άρης Θεσσαλονίκης

Ελπίδες Δράμας-ΑΕΠ Ξάνθης

4η Αγωνιστική (1/11/08) - 13η Αγωνιστική (14/2/09)

ΑΣΕ Ορμή-Αναγέννηση Άρτας

Ελπίδες Δράμας-Αναγέννηση Βύρωνα

Άρης Νίκαιας-Εθνικός Κοζάνης

Νέα Ιωνία-Μ. Αλέξανδρος Γιαννιτσών

ΑΕΠ Ξάνθης-Άρης Θεσσαλονίκης

5η Αγωνιστική (8/11/08) - 14η Αγωνιστική (28/2/09)

Εθνικός Κοζάνης-ΑΣΕ Ορμή

Αναγέννηση Άρτας-Ελπίδες Δράμας

Μ. Αλέξανδρος Γιαννιτσών-Άρης Νίκαιας

Άρης Θεσσαλονίκης-Νέα Ιωνία

Αναγέννηση Βύρωνα-ΑΕΠ Ξάνθης

6η Αγωνιστική (15/11/08) - 15η Αγωνιστική (14/3/09)

ΑΣΕ Ορμή-Μ. Αλέξανδρος Γιαννιτσών

Ελπίδες Δράμας-Εθνικός Κοζάνης

Αναγέννηση Βύρωνα-Αναγέννηση Άρτας

Άρης Νίκαιας-Άρης Θεσσαλονίκης

ΑΕΠ Ξάνθης-Νέα Ιωνία

7η Αγωνιστική (6/12/08) - 16η Αγωνιστική (21/3/09)


Άρης Θεσσαλονίκης-ΑΣΕ Ορμή

Μ. Αλέξανδρος Γιαννιτσών-Ελπίδες Δράμας

Εθνικός Κοζάνης-Αναγέννηση Βύρωνα

Νέα Ιωνία-Άρης Νίκαιας

Αναγέννηση Άρτας-ΑΕΠ Ξάνθης

8η Αγωνιστική (13/12/08) - 17η Αγωνιστική (28/3/09)

ΑΣΕ Ορμή-Νέα Ιωνία

Ελπίδες Δράμας-Άρης Θεσσαλονίκης

Αναγέννηση Βύρωνα-Μ. Αλέξανδρος Γιαννιτσών

Αναγέννηση Άρτας-Εθνικός Κοζάνης

ΑΕΠ Ξάνθης-Άρης Νίκαιας

9η Αγωνιστική (10/1/09) - 18η Αγωνιστική (4/4/09)


Άρης Νίκαιας-ΑΣΕ Ορμή

Νέα Ιωνία-Ελπίδες Δράμας

Άρης Θεσσαλονίκης-Αναγέννηση Βύρωνα

Μ. Αλέξανδρος Γιαννιτσών-Αναγέννηση Άρτας

Εθνικός Κοζάνης-ΑΕΠ Ξάνθης