Στην δεύτερη προκριματική φάση περνούν: Οι 4 πρώτες ομάδες από τους Ομίλους 1 και 5, οι τρεις πρώτες ομάδες από τους Ομίλους 2 και 3 και η πρώτη ομάδα από τους Ομίλους 4, 6, 7 και 8.
Η 5η ομάδα του Ομίλου 1 και οι 4ες ομάδες των Ομίλων 2 και 3 θα παίξουν αγώνες μπαράζ, από τους οποίους και θα προκριθούν οι δύο.

Σύνολο δηλαδή ομάδων, για την επόμενη φάση (28-30 Νοεμβρίου), 20. Η κλήρωση των αγώνων θα γίνει, στα γραφεία της ΚΟΕ, 19 Νοεμβρίου (13:30).

Οι 35 ομάδες του Πρωταθλήματος

Α' όμιλος Αττικής (Ιλίσιο κολυμβητήριο): Ποσειδώνας Ιλισίων, Τρίτων Αμαρουσίου, ΑΟ Πετρούπολης, Πανιώνιος, Ολυμπιακός, Ηλυσιακός

Β όμιλος Αττικής (κολ. Παλαιού Φαλήρου): Εθνικός, Γλυφάδα, Παλαιό Φάληρο, Ιωνικός Νίκαιας, Νηρέας Γέρακα

Γ' όμιλος Αττικής (κολυμβητήριο Βουλιαγμένης): ΓΣ Ηλιούπολης, ΓΣ Περιστερίου, Νηρέας Χαλανδρίου, Βουλιαγμένη, Παναθηναϊκός

Όμιλος Πατρών (κολυμβητήριο Αντώνης Πεπανός): ΝΕ Πατρών, Κέρκυρα, ΟΠΑΘΑ Πατρών, ΝΟ Πατρών

Όμιλος Θεσσαλονίκης (Ποσειδώνιο κολυμβητήριο): ΠΑΟΚ, Άρης, ΟΦΘ, Ηρακλής, ΧΑΝΘ

Όμιλος Βόλου (κολυμβητήριο Βόλου): ΟΥΚ Βόλου, Χαλκίδα, ΝΟΒΑ, ΟΕΑΝΑΒόλου

Όμιλος Κρήτης (κολυμβητήριο Χανίων): Χανιά, ΝΟ Ηρακλείου, Ρέθυμνο

Όμιλος Μυτιλήνης (κολυμβητήριο Μυτιλήνης): Χίος, ΝΟ Μυτιλήνης, ΠΕΚΕ Βροντάδου